Maksimimäärä FITech-opiskelijoita: 5 aikuisopiskelijaa
Kurssin sisältö
Kurssi johdattaa opiskelijat bioinformatiikan keskeisiin käsitteisiin ja menetelmiin. Kurssilla perehdytään DNA- ja proteiinitietokantoihin, sekvenssien vertailuun ja proteiinien 3D-rakenteiden tarkasteluun. Käytännön taitoja harjoitellaan verkkotyökaluilla ja harjoitustehtävillä
- Bioinformatiikan perusteet ja sovellusalueet
- DNA- ja proteiinisekvenssit ja niiden tietokannat
- Proteiinirakenteet, DNA-sekvensointi
- Sekvenssien vertailumenetelmät
- AlphaFold-tekoälymenetelmä
Osaamistavoitteet
Opintojakson suoritettuaan opiskelija osaa kuvata bioinformatiikassa käytettävän datan ja analyysimenetelmät, tuntee keskeisimmät DNA- ja proteiinitietokannat ja osaa hakea niistä tietoa. Opiskelija osaa vertailla sekvenssejä, avata proteiinien 3D-rakenteita verkkotyökaluilla sekä selittää AlphaFold-menetelmän merkityksen proteiinitutkimukselle
Kurssimateriaali
Luentokalvot ja materiaali Moodlessa, lisäksi linkit englanninkielisiin verkkosivuihin ja videoihin. Lisäksi käytetään sekvenssien vertailu- ja proteiinirakenteen visualisointityökaluja (verkkotyökaluja).
Opetuksen aikataulu
Viikottaiset luennot, EXAM-tentti.
Suoritustapa
Luentokalvot ja materiaali Moodlessa, lisäksi linkit englanninkielisiin verkkosivuihin ja videoihin. Tentti EXAM-tenttitilassa, vaihtoehtoja usealla paikkakunnalla.
Kurssin luennot, diat, kotitehtävät ja tentin kysymyspankki ovat suomeksi. Lisäksi kurssilla käytetään englanninkielisiä ohjelmistoja ja verkkosivuja.
Lisätietoja Turun yliopiston opinto-oppaassa.
Tämän kurssin suorituksesta on mahdollista saada digitaalinen suoritusmerkki.